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速度暴涨1000倍!扩散模型预测材料“炼金”过程,体系越复杂加速度越大

2023.12.18

原文来源:量子位

速度暴涨1000倍!扩散模型预测材料“炼金”过程,体系越复杂加速度越大

图片来源:由无界 AI生成

用扩散模型预测化学反应,速度直接暴涨1000倍!

原本需要用计算机硬算几小时甚至一天,现在单个GPU用6秒钟就能搞定。

这是MIT和康奈尔大学联合搞出来的一项新研究,用扩散模型来预测化学反应中最关键的过渡态结构,不仅计算速度提升1000倍,结果也竟然意想不到得准确,相关研究工作发表在Nature Computational Science上:

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其中,麻省理工学院的段辰儒博士是第一加通讯作者。此外,康奈尔大学博士生杜沅岂、麻省理工学院博士生贾皓钧以及麻省理工学院Heather Kulik教授为该论文的共同作者,目前研究已经被MIT News报道。

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要知道,预测反应中的过渡态结构远非想象中简单——

由于能量较高,它存在的时间往往只有飞秒级,即秒的千万亿分之一。

因此,目前还没有一台实验设备能直接观察它,只能通过量子化学计算的方式来预测,计算量少则几小时,多则数天。

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如今用扩散模型就能得到几乎一样的预测结果,这究竟是怎么做到的?

进一步地,用AI预测化学反应,又究竟可以被应用在哪些领域、起到哪些作用?

我们和论文的其中两位作者,来自MIT的段辰儒和康奈尔大学的杜沅岂聊了聊,探讨了一下这项研究具体的原理、背后潜在的应用方向以及关于AI for Science的一些思考。


如何用扩散模型预测化学反应?


首先,需要理解为啥过渡态是研究化学反应的关键。

自远古的“炼金术”以来,化学一直是一门了解和控制物质之间相互作用的学科,化学反应又是其中非常核心的概念。

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通常来说,一个化学反应由三个东西组成:反应物、生成物和过渡态结构。

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反应物和生成物大家都很熟悉了(如氢氧生成水),但实际上,二者之间的过渡态才是解释化学反应的关键——

作为化学反应过程中能量最高的状态,过渡态既能用来理解化学反应的机理、也能估算反应速率和能量。

一言以蔽之,要想真正搞懂、设计、优化并调控一个化学反应,就必须从过渡态结构下手。

所以,过渡态结构究竟要如何研究,又为什么需要用AI来做预测?

研究过渡态结构,不能只用分子结构来分析,而要更进一步研究它的3D构象。

分子结构,指为了便于理解化学反应,会人为构造出单双键这样的概念,并用键合关系、原子种类和数量来表示化学反应。

但要想真正精确计算化学反应的速率和能量,就必须要研究原子在3D空间中的位置关系(用3D坐标表示),即3D构象。只有对比原子在3D空间中的位置关系,才能进行量化分析,从而预测反应发生的过程。

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然而,相比反应物和生成物,过渡态存在的时间非常短,甚至只有飞秒量级。

受限于实验设备精度,过渡态结构无法用肉眼直接观察,此前只能通过量子力学方法——薛定谔方程来计算。

薛定谔方程,量子力学中的基本方程,描述粒子在某段时间内的状态如何变化。

BUT,手搓薛定谔方程计算量巨大,一个苯环的化学反应可能都需要算上一周时间,尤其随着体系增大(原子数量变多等),计算量更是呈现出指数级增长的趋势。

虽然后来出现了密度泛函理论(DFT)等近似方法加速计算,但算起来还是很慢、有时候甚至因为收敛性的问题导致计算不出来,“成本很昂贵,出错率还高”。

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为此,来自MIT和康奈尔大学的研究人员,想到用AI的方法来直接预测过渡态结构,以节省计算量。

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